Rodák zo Žiliny, narodený 30. októbra 1986, začal svoju futbalovú kariéru v drese mládežníckych výberov žilinských šošónov. Pekaríkov debut v najvyššej slovenskej lige – vtedy ešte Corgoň liga, prišiel vo farbách ZŤS Dubnica. Peter v tej sezóne odohral celkovo 27 zápasov a následne sa v lete (2005) presunul naspäť do Žiliny, s ktorou v sezóne 2006/2007 získal ligový titul.
Pekarík si postupne získaval väčšiu a väčšiu pozornosť až si napokon v roku 2009 vybojoval veľký prestup do bundesligového Wolfsburgu, v ktorom okamžite ohúril fantastickými výkonmi. Slovenský reprezentant podpísal s nemeckým klubom 4,5 ročný kontrakt. Jeho debut v Bundeslige prišiel 31. januára 2009 pri remíze s 1. FC Kolín 1:1. Odvtedy sa Peter stal stabilnou súčasťou výberu trénera Felixa Magatha, ktorý napokon dotiahol Wolfsburg po 1. krát v histórii k nemeckému ligovému titulu. V závere sezóny však Pekarík o svoj post v základnej jedenástke prišiel. V drese Wolfsburgu nastúpil celkovo do 55 zápasov.
Trápenie v Turecku, vykúpenie v Herthe
Ďalšie kroky slovenského futbalistu, ktorého zdobí vynikajúca fyzička a ohromná bojovnosť, smerovali na hosťovanie do tureckého Kayserisporu, kde odohral 27 duelov. Po roku v Turecku sa Pekarík vrátil opäť do nemeckej Bundesligy, do ktorej ho prilákala Hertha Berlín. Berlínsky klub sa stal novým Petrovým domovom. 31. marca 2017 strelil Pekarík v Nemecku svoj prvý gól, bolo to do siete Hoffenheimu (Hertha prehrala 3:1) – v tom momente to už bol jeho 151. bundesligový zápas. „V Herthe pôsobím už takmer 6 rokov, celkovo som v Nemecku 8,5. V berlínskom klube som si stihol vybudovať určitú pozíciu. Pre hráča veľa znamená, keď ho všetci rešpektujú a cíti, že jeho slovo má v mužstve určitú váhu. V Herthe sa cítim ako doma a som tu šťastný. Klub si ma chce udržať,“ vyjadril sa Pekarík.
Jednou z najväčších devíz slovenského krajného obrancu je jeho obdivuhodná osobnosť a povaha, pretože aj napriek viacerým sklamaniam: katastrofálne pôsobenie v Turecku, viacero sklamaní v reprezentačnom drese (napr. vystriedanie proti Česku už v 18. minúte) na sebe Peter neprestal tvrdo pracovať a teraz je z neho kapitán Herthy Berlín a dlhodobo jeden z najspoľahlivejších slovenských reprezentantov.
Reprezentačná kariéra
Pekaríkov debut v najcennejšom drese prišiel v zápase proti Spojeným Arabským Emirátom (10. december 2006). Svoj prvý reprezentačný gól strelil pri vysokom víťazstve nad San Marínom 7:0. Peter Pekarík bol stabilnou súčasťou výberu slovenskej futbalovej reprezentácie na Majstrovstvách Sveta 2010 i Majstrovstvách Európy 2016.